病人需接受血压、脉搏及血氧水平检查，医生可能会使用麻醉使病人放松和入眠，但在检查过程中病人的意识是清醒的。

为了不让病人感到疼痛，在向食管插入内镜以前，医生会在病人食管内喷入麻药，或让病人用麻药漱口。病人就绪后，医生会小心地将内镜从病人口中插入，穿过食管，直至胃部。插入内镜后，医生还会注入空气，以增加可视度。

在检查过程中，若医生发现可疑物，则有必要将其取出送检。内镜还能为某些症状提供治疗，如伤口出血等。

一般情况，该检查仅需15—20分钟即可完成。
 

• 病人应如实地向医生告知病史、药物过敏史、常用药及手术史。
• 检查前8-10小时内需禁食禁水，因为胃部的食物残渣会妨碍内镜的正常工作，还可能引起反胃。

尽管上消化道内窥镜检查是一项安全性极高的检查，出现并发症的可能极小，但仍不排除可能会出现以下并发症：

• 穿透肠壁，需输血治疗，但发生的可能性极小。
• 咽喉疼痛、消化不良或腹痛，这些症状会在24小时或更短的时间内自行消失。