สาเหตุที่ทำให้เกิดโรคจมูกอักเสบภูมิแพ้เกิดได้จากหลายปัจจัย ดังนี้

1. Predisposing factor ปัจจัยที่เป็นสาเหตุหลัก ได้แก่ พันธุกรรม
2. Primary or specific factor ปัจจัยที่เป็นสาเหตุโดยตรง ได้แก่ สารก่อภูมิแพ้ เช่น ฝุ่นบ้าน, ไรฝุ่น, เกสรพืช, ชิ้นส่วนหรือสิ่งขับถ่ายของแมลงที่อาศัยอยู่ในบ้าน เช่น แมลงสาบ เป็นต้น
3. Secondary or precipitating factors ปัจจัยที่เป็นเหตุเสริมที่ทำให้อาการแสดงหรือมีอาการมากขึ้น ได้แก่

• โรคติดเชื้อ, สารระคายเคืองต่างๆ เช่น กลิ่นฉุน, ควัน, ฝุ่นละออง
• physical factors เช่น การออกกำลังกาย, การเปลี่ยนแปลงอย่างรวดเร็วของอุณหภูมิ
• psychic factor เช่น เครียด, วิตกกังวล
• ความผิดปกติทางกายวิภาคในจมูก เช่น ผนังกั้นช่องจมูกคด เป็นต้น