ความสำเร็จของการรักษาขึ้นอยู่กับปัจจัยหลายประการ หากมีข้อสงสัยควรปรึกษาแพทย์ก่อนเข้ารับการผ่าตัด
 
จะเป็นอย่างไรหากไม่ได้รับการรักษาด้วยวิธีนี้
กรดไหลย้อนอาจก่อให้เกิดอาการแสบร้อนกลางอกหรือกรดในช่องปาก กรดนี้สามารถทำให้หลอดอาหารอักเสบ เกิดแผลเป็น หรือกลายเป็นภาวะการอักเสบเรื้อรังของหลอดอาหาร (Barrett’s esophagus) ซึ่งอาจนำไปสู่การเกิดมะเร็งหลอดอาหาร การผ่าตัดอาจเป็นการรักษาที่แนะนำสำหรับผู้ป่วยที่ยังคงมีอาการของโรคกรดไหลย้อนอยู่แม้ในขณะที่กำลังได้รับการรักษาด้วยยา

ยาที่ช่วยลดปริมาณกรดในกระเพาะอาหารมีประสิทธิภาพในการควบคุมอาการและรักษาอาการอักเสบ การรักษาด้วยวิธีการผ่าตัดจะแนะนำเฉพาะเมื่อผู้ป่วยยังคงมีอาการอย่างต่อเนื่องหรือไม่ต้องการที่จะรักษาด้วยยาอีกต่อไปเนื่องจากมีผลแทรกซ้อนที่รุนแรง เช่น หลอดอาหารอักเสบ หรือหลอดอาหารอักเสบเรื้อรัง (Barrett’s esophagus) ซึ่งอาจนำไปสู่การเกิดมะเร็งหลอดอาหาร